پس از احصاء نیازها، چالش ها و مشکلات بخش سلامت و بررسی وضعیت موجود؛ اولویت‌های پژوهشی به روز شده دانشگاه علوم پزشکی شهرکرد در حیطه های مختلف با برگزاری جلسات هم اندیشی و استفاده از نظرات و دیدگاه های متخصصان و صاحب نظران تعیین گردید. اولویت های پژوهشی دانشگاه به شرح پیوست جهت بهره برداری ذینفعان پژوهش ارائه می گردد.